Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CSNK2A1P68400 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms