Protein–RNA interactions for Protein: P61011

SRP54, Signal recognition particle 54 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54P61011 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP54P61011 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP54P61011 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP54P61011 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP54P61011 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP54P61011 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP54P61011 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP54P61011 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP54P61011 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP54P61011 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP54P61011 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP54P61011 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP54P61011 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP54P61011 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP54P61011 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP54P61011 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP54P61011 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP54P61011 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP54P61011 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP54P61011 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP54P61011 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP54P61011 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRP54P61011 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRP54P61011 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRP54P61011 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRP54P61011 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRP54P61011 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRP54P61011 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRP54P61011 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRP54P61011 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRP54P61011 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRP54P61011 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRP54P61011 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRP54P61011 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP54P61011 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP54P61011 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP54P61011 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP54P61011 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP54P61011 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP54P61011 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP54P61011 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP54P61011 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP54P61011 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP54P61011 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP54P61011 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP54P61011 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP54P61011 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP54P61011 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP54P61011 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP54P61011 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRP54P61011 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRP54P61011 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRP54P61011 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SRP54P61011 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRP54P61011 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRP54P61011 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRP54P61011 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRP54P61011 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRP54P61011 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRP54P61011 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRP54P61011 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRP54P61011 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRP54P61011 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRP54P61011 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRP54P61011 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRP54P61011 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SRP54P61011 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRP54P61011 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRP54P61011 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRP54P61011 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRP54P61011 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRP54P61011 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRP54P61011 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRP54P61011 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRP54P61011 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRP54P61011 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRP54P61011 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRP54P61011 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRP54P61011 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRP54P61011 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRP54P61011 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRP54P61011 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRP54P61011 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRP54P61011 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRP54P61011 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SRP54P61011 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRP54P61011 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRP54P61011 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRP54P61011 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRP54P61011 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRP54P61011 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRP54P61011 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRP54P61011 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRP54P61011 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRP54P61011 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRP54P61011 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRP54P61011 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRP54P61011 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRP54P61011 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SRP54P61011 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms