Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AIF1P55008 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AIF1P55008 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AIF1P55008 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AIF1P55008 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AIF1P55008 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AIF1P55008 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AIF1P55008 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AIF1P55008 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AIF1P55008 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AIF1P55008 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AIF1P55008 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AIF1P55008 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AIF1P55008 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AIF1P55008 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AIF1P55008 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AIF1P55008 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AIF1P55008 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AIF1P55008 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AIF1P55008 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AIF1P55008 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AIF1P55008 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AIF1P55008 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AIF1P55008 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
AIF1P55008 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AIF1P55008 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AIF1P55008 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AIF1P55008 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AIF1P55008 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AIF1P55008 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AIF1P55008 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AIF1P55008 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AIF1P55008 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AIF1P55008 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AIF1P55008 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AIF1P55008 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AIF1P55008 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AIF1P55008 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
AIF1P55008 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AIF1P55008 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AIF1P55008 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AIF1P55008 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AIF1P55008 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AIF1P55008 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AIF1P55008 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AIF1P55008 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
AIF1P55008 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AIF1P55008 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AIF1P55008 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AIF1P55008 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AIF1P55008 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AIF1P55008 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AIF1P55008 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AIF1P55008 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AIF1P55008 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AIF1P55008 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AIF1P55008 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AIF1P55008 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AIF1P55008 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AIF1P55008 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AIF1P55008 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AIF1P55008 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AIF1P55008 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AIF1P55008 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AIF1P55008 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AIF1P55008 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AIF1P55008 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AIF1P55008 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AIF1P55008 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AIF1P55008 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
AIF1P55008 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AIF1P55008 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AIF1P55008 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AIF1P55008 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AIF1P55008 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AIF1P55008 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AIF1P55008 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AIF1P55008 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AIF1P55008 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AIF1P55008 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
AIF1P55008 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
AIF1P55008 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AIF1P55008 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AIF1P55008 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AIF1P55008 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AIF1P55008 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AIF1P55008 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AIF1P55008 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AIF1P55008 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AIF1P55008 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AIF1P55008 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AIF1P55008 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AIF1P55008 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AIF1P55008 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AIF1P55008 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AIF1P55008 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AIF1P55008 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AIF1P55008 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AIF1P55008 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AIF1P55008 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms