Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC1A2P43004 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A2P43004 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms