Protein–RNA interactions for Protein: P19793

RXRA, Retinoic acid receptor RXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRAP19793 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RXRAP19793 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RXRAP19793 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RXRAP19793 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RXRAP19793 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RXRAP19793 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RXRAP19793 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RXRAP19793 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RXRAP19793 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RXRAP19793 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RXRAP19793 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RXRAP19793 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RXRAP19793 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RXRAP19793 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RXRAP19793 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RXRAP19793 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RXRAP19793 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RXRAP19793 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RXRAP19793 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RXRAP19793 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RXRAP19793 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RXRAP19793 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RXRAP19793 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RXRAP19793 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RXRAP19793 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RXRAP19793 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RXRAP19793 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RXRAP19793 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RXRAP19793 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RXRAP19793 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RXRAP19793 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RXRAP19793 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RXRAP19793 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RXRAP19793 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RXRAP19793 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RXRAP19793 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RXRAP19793 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RXRAP19793 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RXRAP19793 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RXRAP19793 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RXRAP19793 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RXRAP19793 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RXRAP19793 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RXRAP19793 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RXRAP19793 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RXRAP19793 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RXRAP19793 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RXRAP19793 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RXRAP19793 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RXRAP19793 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RXRAP19793 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RXRAP19793 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RXRAP19793 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RXRAP19793 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RXRAP19793 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RXRAP19793 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RXRAP19793 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RXRAP19793 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RXRAP19793 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RXRAP19793 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RXRAP19793 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RXRAP19793 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RXRAP19793 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RXRAP19793 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RXRAP19793 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RXRAP19793 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RXRAP19793 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RXRAP19793 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RXRAP19793 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RXRAP19793 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RXRAP19793 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RXRAP19793 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RXRAP19793 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RXRAP19793 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RXRAP19793 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RXRAP19793 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RXRAP19793 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RXRAP19793 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RXRAP19793 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RXRAP19793 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RXRAP19793 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RXRAP19793 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RXRAP19793 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RXRAP19793 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RXRAP19793 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RXRAP19793 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RXRAP19793 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RXRAP19793 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RXRAP19793 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RXRAP19793 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RXRAP19793 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RXRAP19793 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RXRAP19793 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RXRAP19793 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RXRAP19793 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RXRAP19793 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RXRAP19793 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RXRAP19793 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RXRAP19793 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RXRAP19793 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms