Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCG2P13521 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCG2P13521 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCG2P13521 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCG2P13521 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCG2P13521 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCG2P13521 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCG2P13521 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCG2P13521 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCG2P13521 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SCG2P13521 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCG2P13521 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCG2P13521 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCG2P13521 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCG2P13521 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCG2P13521 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCG2P13521 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCG2P13521 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCG2P13521 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCG2P13521 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCG2P13521 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCG2P13521 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCG2P13521 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SCG2P13521 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SCG2P13521 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCG2P13521 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCG2P13521 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCG2P13521 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCG2P13521 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCG2P13521 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SCG2P13521 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCG2P13521 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCG2P13521 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SCG2P13521 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SCG2P13521 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
SCG2P13521 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SCG2P13521 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCG2P13521 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCG2P13521 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCG2P13521 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SCG2P13521 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCG2P13521 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCG2P13521 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCG2P13521 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCG2P13521 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCG2P13521 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCG2P13521 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCG2P13521 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SCG2P13521 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCG2P13521 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCG2P13521 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCG2P13521 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCG2P13521 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SCG2P13521 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SCG2P13521 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SCG2P13521 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCG2P13521 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCG2P13521 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCG2P13521 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCG2P13521 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCG2P13521 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCG2P13521 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCG2P13521 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCG2P13521 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SCG2P13521 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SCG2P13521 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCG2P13521 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCG2P13521 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCG2P13521 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCG2P13521 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCG2P13521 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCG2P13521 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCG2P13521 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCG2P13521 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCG2P13521 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCG2P13521 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCG2P13521 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCG2P13521 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCG2P13521 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCG2P13521 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCG2P13521 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCG2P13521 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCG2P13521 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCG2P13521 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCG2P13521 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCG2P13521 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCG2P13521 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCG2P13521 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCG2P13521 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCG2P13521 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SCG2P13521 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCG2P13521 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCG2P13521 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCG2P13521 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCG2P13521 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCG2P13521 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCG2P13521 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SCG2P13521 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCG2P13521 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCG2P13521 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.2 ms