Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RLBP1P12271 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RLBP1P12271 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RLBP1P12271 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RLBP1P12271 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RLBP1P12271 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RLBP1P12271 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RLBP1P12271 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RLBP1P12271 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RLBP1P12271 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RLBP1P12271 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RLBP1P12271 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RLBP1P12271 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RLBP1P12271 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RLBP1P12271 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RLBP1P12271 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RLBP1P12271 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RLBP1P12271 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RLBP1P12271 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RLBP1P12271 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RLBP1P12271 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RLBP1P12271 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RLBP1P12271 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RLBP1P12271 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RLBP1P12271 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
RLBP1P12271 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RLBP1P12271 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RLBP1P12271 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RLBP1P12271 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RLBP1P12271 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RLBP1P12271 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RLBP1P12271 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RLBP1P12271 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
RLBP1P12271 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RLBP1P12271 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RLBP1P12271 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RLBP1P12271 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RLBP1P12271 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RLBP1P12271 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RLBP1P12271 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RLBP1P12271 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RLBP1P12271 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RLBP1P12271 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RLBP1P12271 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RLBP1P12271 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RLBP1P12271 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RLBP1P12271 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RLBP1P12271 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
RLBP1P12271 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RLBP1P12271 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RLBP1P12271 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RLBP1P12271 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RLBP1P12271 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RLBP1P12271 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RLBP1P12271 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RLBP1P12271 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RLBP1P12271 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RLBP1P12271 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RLBP1P12271 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RLBP1P12271 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RLBP1P12271 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RLBP1P12271 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RLBP1P12271 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RLBP1P12271 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RLBP1P12271 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RLBP1P12271 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RLBP1P12271 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RLBP1P12271 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RLBP1P12271 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RLBP1P12271 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RLBP1P12271 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RLBP1P12271 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RLBP1P12271 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RLBP1P12271 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RLBP1P12271 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RLBP1P12271 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RLBP1P12271 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RLBP1P12271 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RLBP1P12271 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RLBP1P12271 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RLBP1P12271 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RLBP1P12271 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RLBP1P12271 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RLBP1P12271 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RLBP1P12271 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RLBP1P12271 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RLBP1P12271 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RLBP1P12271 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RLBP1P12271 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RLBP1P12271 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RLBP1P12271 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RLBP1P12271 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RLBP1P12271 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RLBP1P12271 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RLBP1P12271 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RLBP1P12271 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RLBP1P12271 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RLBP1P12271 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RLBP1P12271 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RLBP1P12271 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms