Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTHFD1P11586 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTHFD1P11586 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms