Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF2P04141 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF2P04141 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF2P04141 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF2P04141 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF2P04141 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF2P04141 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF2P04141 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF2P04141 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF2P04141 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF2P04141 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF2P04141 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF2P04141 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF2P04141 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF2P04141 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF2P04141 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF2P04141 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF2P04141 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF2P04141 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF2P04141 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF2P04141 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF2P04141 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF2P04141 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF2P04141 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF2P04141 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF2P04141 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF2P04141 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF2P04141 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF2P04141 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF2P04141 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF2P04141 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF2P04141 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF2P04141 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF2P04141 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF2P04141 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF2P04141 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF2P04141 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF2P04141 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF2P04141 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF2P04141 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF2P04141 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF2P04141 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF2P04141 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF2P04141 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF2P04141 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF2P04141 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF2P04141 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF2P04141 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF2P04141 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF2P04141 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF2P04141 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF2P04141 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF2P04141 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF2P04141 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF2P04141 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF2P04141 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF2P04141 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF2P04141 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF2P04141 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF2P04141 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF2P04141 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF2P04141 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF2P04141 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF2P04141 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF2P04141 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF2P04141 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF2P04141 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF2P04141 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF2P04141 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF2P04141 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF2P04141 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF2P04141 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF2P04141 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF2P04141 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF2P04141 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSF2P04141 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSF2P04141 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CSF2P04141 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSF2P04141 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CSF2P04141 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSF2P04141 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSF2P04141 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CSF2P04141 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSF2P04141 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF2P04141 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF2P04141 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF2P04141 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF2P04141 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF2P04141 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF2P04141 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF2P04141 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF2P04141 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSF2P04141 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSF2P04141 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSF2P04141 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSF2P04141 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSF2P04141 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSF2P04141 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CSF2P04141 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSF2P04141 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms