Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PRPF40AO75400 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
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