Protein–RNA interactions for Protein: O15049

N4BP3, NEDD4-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP3O15049 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
N4BP3O15049 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
N4BP3O15049 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
N4BP3O15049 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
N4BP3O15049 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
N4BP3O15049 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
N4BP3O15049 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
N4BP3O15049 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
N4BP3O15049 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms