Protein–RNA interactions for Protein: F8VUJ3

POC1B-GALNT4, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POC1B-GALNT4F8VUJ3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POC1B-GALNT4F8VUJ3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
POC1B-GALNT4F8VUJ3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POC1B-GALNT4F8VUJ3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POC1B-GALNT4F8VUJ3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POC1B-GALNT4F8VUJ3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POC1B-GALNT4F8VUJ3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POC1B-GALNT4F8VUJ3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POC1B-GALNT4F8VUJ3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POC1B-GALNT4F8VUJ3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms