Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 PANK3-201ENST00000239231 10506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.183e-9■■■■■ 112.9
DROSHAQ9NRR4 PANK3-202ENST00000520504 313 ntTSL 52.5□□□□□ -2.013e-9■■■■■ 112.9
DROSHAQ9NRR4 SREBF2-203ENST00000435061 770 ntTSL 326.77■■□□□ 1.882e-8■■■■■ 109.5
DROSHAQ9NRR4 MIR744-201ENST00000578242 98 ntBASIC12.72□□□□□ -0.376e-13■■■■■ 107.4
DROSHAQ9NRR4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.992e-9■■■■■ 106.6
DROSHAQ9NRR4 CARS2-209ENST00000535398 1878 ntTSL 231.12■■■□□ 2.572e-9■■■■■ 106.6
DROSHAQ9NRR4 CARS2-230ENST00000543487 870 ntTSL 529.93■■■□□ 2.382e-9■■■■■ 106.6
DROSHAQ9NRR4 CARS2-212ENST00000537386 739 ntTSL 429.53■■■□□ 2.322e-9■■■■■ 106.6
DROSHAQ9NRR4 CARS2-225ENST00000541362 1051 ntTSL 228.66■■■□□ 2.182e-9■■■■■ 106.6
DROSHAQ9NRR4 CARS2-206ENST00000481787 1223 ntTSL 527.59■■■□□ 2.012e-9■■■■■ 106.6
DROSHAQ9NRR4 CARS2-208ENST00000487253 844 ntTSL 526.55■■□□□ 1.842e-9■■■■■ 106.6
DROSHAQ9NRR4 CARS2-232ENST00000545506 788 ntTSL 325.51■■□□□ 1.672e-9■■■■■ 106.6
DROSHAQ9NRR4 CARS2-210ENST00000535516 2313 ntTSL 525.02■■□□□ 1.62e-9■■■■■ 106.6
DROSHAQ9NRR4 CARS2-220ENST00000540006 1485 ntTSL 224.1■■□□□ 1.452e-9■■■■■ 106.6
DROSHAQ9NRR4 CARS2-202ENST00000375781 2747 ntTSL 221.08■□□□□ 0.962e-9■■■■■ 106.6
DROSHAQ9NRR4 CARS2-219ENST00000539405 1041 ntTSL 318.86■□□□□ 0.612e-9■■■■■ 106.6
DROSHAQ9NRR4 CARS2-217ENST00000537802 3225 ntTSL 218.13■□□□□ 0.492e-9■■■■■ 106.6
DROSHAQ9NRR4 CARS2-211ENST00000535615 711 ntTSL 517.67■□□□□ 0.422e-9■■■■■ 106.6
DROSHAQ9NRR4 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.57□□□□□ -2.161e-10■■■■■ 106.2
DROSHAQ9NRR4 EGFL7-206ENST00000492002 654 ntTSL 536.67■■■■□ 3.463e-25■■■■■ 105.9
DROSHAQ9NRR4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.553e-25■■■■■ 105.9
DROSHAQ9NRR4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.533e-25■■■■■ 105.9
DROSHAQ9NRR4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.13e-25■■■■■ 105.9
DROSHAQ9NRR4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.043e-25■■■■■ 105.9
DROSHAQ9NRR4 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.591e-6■■■■■ 105.4
DROSHAQ9NRR4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.475e-7■■■■■ 105.2
DROSHAQ9NRR4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.355e-7■■■■■ 105.2
DROSHAQ9NRR4 CCDC88B-204ENST00000463837 5235 ntTSL 223.24■■□□□ 1.315e-7■■■■■ 105.2
DROSHAQ9NRR4 CCDC88B-209ENST00000494080 4563 ntTSL 220.73■□□□□ 0.915e-7■■■■■ 105.2
DROSHAQ9NRR4 NKD1-202ENST00000564336 477 ntTSL 334.86■■■■□ 3.173e-16■■■■■ 104.7
DROSHAQ9NRR4 SREBF2-208ENST00000491541 4043 ntTSL 1 (best)15.69■□□□□ 0.11e-7■■■■■ 104
DROSHAQ9NRR4 NKD1-201ENST00000268459 17105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.582e-12■■■■■ 103.2
DROSHAQ9NRR4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.52e-25■■■■■ 102.2
DROSHAQ9NRR4 MMP25-AS1-208ENST00000573953 1001 ntTSL 329.83■■■□□ 2.372e-25■■■■■ 102.2
DROSHAQ9NRR4 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.482e-8■■■■■ 101.5
DROSHAQ9NRR4 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC4.83□□□□□ -1.649e-8■■■■■ 99.8
DROSHAQ9NRR4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.172e-7■■■■■ 99
DROSHAQ9NRR4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.042e-7■■■■■ 99
DROSHAQ9NRR4 SREBF2-202ENST00000424354 5699 ntTSL 1 (best)17.18■□□□□ 0.342e-7■■■■■ 99
DROSHAQ9NRR4 ESRRB-203ENST00000507951 736 ntTSL 322.94■■□□□ 1.262e-7■■■■■ 97.7
DROSHAQ9NRR4 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.252e-7■■■■■ 97.7
DROSHAQ9NRR4 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.441e-82■■■■■ 97.6
DROSHAQ9NRR4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.071e-13■■■■■ 97.4
DROSHAQ9NRR4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.071e-13■■■■■ 97.4
DROSHAQ9NRR4 ZFAND2A-202ENST00000397083 852 ntTSL 1 (best)27.99■■■□□ 2.071e-13■■■■■ 97.4
DROSHAQ9NRR4 ZFAND2A-204ENST00000471448 542 ntTSL 214.51□□□□□ -0.091e-13■■■■■ 97.4
DROSHAQ9NRR4 ZFAND2A-207ENST00000574135 433 ntTSL 312.36□□□□□ -0.431e-13■■■■■ 97.4
DROSHAQ9NRR4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.162e-7■■■■■ 97.2
DROSHAQ9NRR4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.942e-7■■■■■ 97.2
DROSHAQ9NRR4 DIP2C-205ENST00000634311 4961 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.162e-7■■■■■ 96.8
DROSHAQ9NRR4 DIP2C-201ENST00000280886 7888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.432e-7■■■■■ 96.8
DROSHAQ9NRR4 RAP1GAP-202ENST00000317967 600 ntTSL 224.25■■□□□ 1.471e-6■■■■■ 96.5
DROSHAQ9NRR4 RAP1GAP-213ENST00000611549 4294 ntTSL 517.21■□□□□ 0.351e-6■■■■■ 96.5
DROSHAQ9NRR4 RAP1GAP-201ENST00000290101 3584 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.331e-6■■■■■ 96.5
DROSHAQ9NRR4 RAP1GAP-206ENST00000374765 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.231e-6■■■■■ 96.5
DROSHAQ9NRR4 RAP1GAP-212ENST00000542643 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.141e-6■■■■■ 96.5
DROSHAQ9NRR4 RAP1GAP-208ENST00000464457 409 ntTSL 313.19□□□□□ -0.31e-6■■■■■ 96.5
DROSHAQ9NRR4 RAP1GAP-210ENST00000482984 331 ntTSL 56.51□□□□□ -1.378e-13■■■■■ 96.5
DROSHAQ9NRR4 MIR106B-201ENST00000385301 82 ntBASIC12.34□□□□□ -0.435e-17■■■■■ 95.5
DROSHAQ9NRR4 MIR503-201ENST00000385270 71 ntBASIC14.79□□□□□ -0.041e-26■■■■■ 94.6
DROSHAQ9NRR4 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.782e-7■■■■■ 94
DROSHAQ9NRR4 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC1.74□□□□□ -2.138e-15■■■■■ 93.8
DROSHAQ9NRR4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.431e-7■■■■■ 93.4
DROSHAQ9NRR4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.431e-7■■■■■ 93.4
DROSHAQ9NRR4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.371e-7■■■■■ 93.4
DROSHAQ9NRR4 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.161e-7■■■■■ 93.4
DROSHAQ9NRR4 AC048341.3-201ENST00000619323 491 ntBASIC11.89□□□□□ -0.511e-22■■■■■ 92.8
DROSHAQ9NRR4 MIRLET7E-201ENST00000362102 79 ntBASIC16.89■□□□□ 0.36e-12■■■■■ 92.3
DROSHAQ9NRR4 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC9.43□□□□□ -0.96e-12■■■■■ 92.3
DROSHAQ9NRR4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.981e-11■■■■■ 91.7
DROSHAQ9NRR4 MIR202HG-202ENST00000553459 674 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.221e-11■■■■■ 91.7
DROSHAQ9NRR4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.61e-7■■■■■ 90.8
DROSHAQ9NRR4 CABLES1-210ENST00000585061 584 ntTSL 520.24■□□□□ 0.831e-7■■■■■ 90.8
DROSHAQ9NRR4 CABLES1-205ENST00000579963 2074 ntTSL 215.92■□□□□ 0.141e-7■■■■■ 90.8
DROSHAQ9NRR4 CABLES1-203ENST00000420687 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.311e-7■■■■■ 90.8
DROSHAQ9NRR4 CABLES1-202ENST00000400473 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.331e-7■■■■■ 90.8
DROSHAQ9NRR4 MIR25-201ENST00000384816 84 ntBASIC14.18□□□□□ -0.143e-18■■■■■ 90.5
DROSHAQ9NRR4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC29.4■■■□□ 2.38e-9■■■■■ 89.8
DROSHAQ9NRR4 ATP9B-207ENST00000586672 583 ntTSL 422.23■■□□□ 1.158e-9■■■■■ 89.8
DROSHAQ9NRR4 ATP9B-203ENST00000458297 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.348e-9■■■■■ 89.8
DROSHAQ9NRR4 ATP9B-201ENST00000307671 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.18e-9■■■■■ 89.8
DROSHAQ9NRR4 ATP9B-202ENST00000426216 4361 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.448e-9■■■■■ 89.8
DROSHAQ9NRR4 ATP9B-204ENST00000490210 7353 ntTSL 1 (best)12□□□□□ -0.498e-9■■■■■ 89.8
DROSHAQ9NRR4 ATP9B-206ENST00000586366 2845 ntTSL 211.59□□□□□ -0.558e-9■■■■■ 89.8
DROSHAQ9NRR4 ATP9B-221ENST00000590271 1923 ntTSL 29.69□□□□□ -0.868e-9■■■■■ 89.8
DROSHAQ9NRR4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.948e-8■■■■■ 89.1
DROSHAQ9NRR4 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.438e-8■■■■■ 89.1
DROSHAQ9NRR4 FAM120B-201ENST00000476287 5155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.348e-8■■■■■ 89.1
DROSHAQ9NRR4 FAM120B-203ENST00000537664 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.578e-8■■■■■ 89.1
DROSHAQ9NRR4 ANK1-209ENST00000520299 3587 ntTSL 213.18□□□□□ -0.33e-7■■■■■ 88.6
DROSHAQ9NRR4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.358e-8■■■■■ 87.4
DROSHAQ9NRR4 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.314e-7■■■■■ 87.1
DROSHAQ9NRR4 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.114e-7■■■■■ 87.1
DROSHAQ9NRR4 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.054e-7■■■■■ 87.1
DROSHAQ9NRR4 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC3□□□□□ -1.932e-11■■■■■ 86.7
DROSHAQ9NRR4 ESRRB-206ENST00000512784 1826 ntTSL 523.82■■□□□ 1.49e-7■■■■■ 85.9
DROSHAQ9NRR4 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.79e-7■■■■■ 85.9
DROSHAQ9NRR4 ESRRB-204ENST00000509242 2849 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.669e-7■■■■■ 85.9
DROSHAQ9NRR4 ESRRB-202ENST00000505752 2432 ntTSL 1 (best)18.17■□□□□ 0.59e-7■■■■■ 85.9
DROSHAQ9NRR4 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC8.77□□□□□ -1.015e-10■■■■■ 85.8
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