Protein–RNA interactions for Protein: Q12072

IOC2, ISWI one complex protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
IOC2Q12072 VPS28YPL065W 729 nt11.87□□□□□ -0.51
IOC2Q12072 RSM23YGL129C 1353 nt11.87□□□□□ -0.51
IOC2Q12072 ARP6YLR085C 1317 nt11.86□□□□□ -0.51
IOC2Q12072 GFD2YCL036W 1701 nt11.86□□□□□ -0.51
IOC2Q12072 YGR011WYGR011W 327 nt11.86□□□□□ -0.51
IOC2Q12072 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt11.86□□□□□ -0.51
IOC2Q12072 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.86□□□□□ -0.51
IOC2Q12072 YHR054CYHR054C 1065 nt11.85□□□□□ -0.51
IOC2Q12072 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt11.85□□□□□ -0.51
IOC2Q12072 WHI5YOR083W 888 nt11.85□□□□□ -0.51
IOC2Q12072 TSR2YLR435W 618 nt11.84□□□□□ -0.51
IOC2Q12072 ZTA1YBR046C 1005 nt11.84□□□□□ -0.51
IOC2Q12072 PET9YBL030C 957 nt11.83□□□□□ -0.52
IOC2Q12072 TIR4YOR009W 1464 nt11.82□□□□□ -0.52
IOC2Q12072 IRC15YPL017C 1500 nt11.81□□□□□ -0.52
IOC2Q12072 YCH1YGR203W 447 nt11.81□□□□□ -0.52
IOC2Q12072 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt11.81□□□□□ -0.52
IOC2Q12072 RSA3YLR221C 663 nt11.81□□□□□ -0.52
IOC2Q12072 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.78□□□□□ -0.52
IOC2Q12072 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.78□□□□□ -0.52
IOC2Q12072 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.78□□□□□ -0.52
IOC2Q12072 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.78□□□□□ -0.52
IOC2Q12072 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.78□□□□□ -0.52
IOC2Q12072 YJL152WYJL152W 360 nt11.78□□□□□ -0.52
IOC2Q12072 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt11.78□□□□□ -0.52
IOC2Q12072 YOL150CYOL150C 312 nt11.78□□□□□ -0.52
IOC2Q12072 YJL225CYJL225C 5277 nt11.78□□□□□ -0.52
IOC2Q12072 MOD5YOR274W 1287 nt11.77□□□□□ -0.53
IOC2Q12072 MPC1YGL080W 393 nt11.76□□□□□ -0.53
IOC2Q12072 ECM9YKR004C 1134 nt11.76□□□□□ -0.53
IOC2Q12072 RTS2YOR077W 699 nt11.76□□□□□ -0.53
IOC2Q12072 MCT1YOR221C 1083 nt11.76□□□□□ -0.53
IOC2Q12072 TGS1YPL157W 948 nt11.76□□□□□ -0.53
IOC2Q12072 RER1YCL001W 567 nt11.76□□□□□ -0.53
IOC2Q12072 YMR057CYMR057C 372 nt11.75□□□□□ -0.53
IOC2Q12072 PUS2YGL063W 1113 nt11.74□□□□□ -0.53
IOC2Q12072 DIA1YMR316W 1011 nt11.74□□□□□ -0.53
IOC2Q12072 GIS3YLR094C 1509 nt11.74□□□□□ -0.53
IOC2Q12072 SCC4YER147C 1875 nt11.74□□□□□ -0.53
IOC2Q12072 BI2Q0110 1272 nt11.72□□□□□ -0.53
IOC2Q12072 TAZ1YPR140W 1146 nt11.72□□□□□ -0.53
IOC2Q12072 YDL157CYDL157C 357 nt11.71□□□□□ -0.53
IOC2Q12072 YHP1YDR451C 1062 nt11.71□□□□□ -0.53
IOC2Q12072 FIP1YJR093C 984 nt11.71□□□□□ -0.53
IOC2Q12072 YJL118WYJL118W 660 nt11.7□□□□□ -0.54
IOC2Q12072 SUT2YPR009W 807 nt11.69□□□□□ -0.54
IOC2Q12072 BOR1YNL275W 1731 nt11.68□□□□□ -0.54
IOC2Q12072 RTF1YGL244W 1677 nt11.68□□□□□ -0.54
IOC2Q12072 CSI1YMR025W 888 nt11.66□□□□□ -0.54
IOC2Q12072 SED5YLR026C 1023 nt11.64□□□□□ -0.55
IOC2Q12072 CUE1YMR264W 612 nt11.64□□□□□ -0.55
IOC2Q12072 PRM4YPL156C 855 nt11.64□□□□□ -0.55
IOC2Q12072 YDL158CYDL158C 309 nt11.63□□□□□ -0.55
IOC2Q12072 IMP2'YIL154C 1041 nt11.63□□□□□ -0.55
IOC2Q12072 YLR311CYLR311C 348 nt11.63□□□□□ -0.55
IOC2Q12072 RAD17YOR368W 1206 nt11.62□□□□□ -0.55
IOC2Q12072 YGL118CYGL118C 438 nt11.6□□□□□ -0.55
IOC2Q12072 SUT1YGL162W 900 nt11.6□□□□□ -0.55
IOC2Q12072 MSA2YKR077W 1092 nt11.6□□□□□ -0.55
IOC2Q12072 YMR144WYMR144W 1029 nt11.6□□□□□ -0.55
IOC2Q12072 DSK2YMR276W 1122 nt11.6□□□□□ -0.55
IOC2Q12072 PEX34YCL056C 435 nt11.6□□□□□ -0.55
IOC2Q12072 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.59□□□□□ -0.55
IOC2Q12072 CBS1YDL069C 690 nt11.58□□□□□ -0.56
IOC2Q12072 ERG29YMR134W 714 nt11.58□□□□□ -0.56
IOC2Q12072 YSC84YHR016C 1407 nt11.58□□□□□ -0.56
IOC2Q12072 PTK1YKL198C 1989 nt11.57□□□□□ -0.56
IOC2Q12072 ERG12YMR208W 1332 nt11.57□□□□□ -0.56
IOC2Q12072 PCL6YER059W 1263 nt11.56□□□□□ -0.56
IOC2Q12072 IDH1YNL037C 1083 nt11.56□□□□□ -0.56
IOC2Q12072 MRPL36YBR122C 534 nt11.56□□□□□ -0.56
IOC2Q12072 HMRA1YCR097W 381 nt11.55□□□□□ -0.56
IOC2Q12072 YNL303WYNL303W 348 nt11.55□□□□□ -0.56
IOC2Q12072 OSW1YOR255W 837 nt11.55□□□□□ -0.56
IOC2Q12072 LIP2YLR239C 987 nt11.54□□□□□ -0.56
IOC2Q12072 PIC2YER053C 903 nt11.53□□□□□ -0.56
IOC2Q12072 SCEIQ0160 708 nt11.53□□□□□ -0.56
IOC2Q12072 YIL100WYIL100W 354 nt11.53□□□□□ -0.56
IOC2Q12072 YLR283WYLR283W 945 nt11.53□□□□□ -0.56
IOC2Q12072 YHL050CYHL050C 2094 nt11.53□□□□□ -0.56
IOC2Q12072 CHA1YCL064C 1083 nt11.51□□□□□ -0.57
IOC2Q12072 ERV29YGR284C 933 nt11.51□□□□□ -0.57
IOC2Q12072 CCE1YKL011C 1062 nt11.51□□□□□ -0.57
IOC2Q12072 YLR236CYLR236C 324 nt11.51□□□□□ -0.57
IOC2Q12072 YOL107WYOL107W 1029 nt11.51□□□□□ -0.57
IOC2Q12072 BOP3YNL042W 1191 nt11.5□□□□□ -0.57
IOC2Q12072 YBL081WYBL081W 1107 nt11.5□□□□□ -0.57
IOC2Q12072 YPR011CYPR011C 981 nt11.5□□□□□ -0.57
IOC2Q12072 YGR168CYGR168C 1131 nt11.49□□□□□ -0.57
IOC2Q12072 YNL234WYNL234W 1281 nt11.49□□□□□ -0.57
IOC2Q12072 AME1YBR211C 975 nt11.49□□□□□ -0.57
IOC2Q12072 SLX1YBR228W 915 nt11.48□□□□□ -0.57
IOC2Q12072 BNA3YJL060W 1335 nt11.47□□□□□ -0.57
IOC2Q12072 GBP2YCL011C 1284 nt11.47□□□□□ -0.57
IOC2Q12072 MCH5YOR306C 1566 nt11.45□□□□□ -0.58
IOC2Q12072 YHR145CYHR145C 357 nt11.45□□□□□ -0.58
IOC2Q12072 PZF1YPR186C 1290 nt11.44□□□□□ -0.58
IOC2Q12072 FMP45YDL222C 930 nt11.43□□□□□ -0.58
IOC2Q12072 YNL195CYNL195C 786 nt11.43□□□□□ -0.58
IOC2Q12072 YIF1YNL263C 945 nt11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 52.4 ms