Protein–RNA interactions for Protein: Q12072

IOC2, ISWI one complex protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
IOC2Q12072 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.67□□□□□ -2.3
IOC2Q12072 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.67□□□□□ -2.3
IOC2Q12072 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.67□□□□□ -2.3
IOC2Q12072 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.67□□□□□ -2.3
IOC2Q12072 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.67□□□□□ -2.3
IOC2Q12072 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.67□□□□□ -2.3
IOC2Q12072 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.67□□□□□ -2.3
IOC2Q12072 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.67□□□□□ -2.3
IOC2Q12072 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.67□□□□□ -2.3
IOC2Q12072 URB1YKL014C 5295 nt0.45□□□□□ -2.34
IOC2Q12072 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt0.45□□□□□ -2.34
IOC2Q12072 CDC65tQ(CUG)M 72 nt0.44□□□□□ -2.34
IOC2Q12072 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.44□□□□□ -2.34
IOC2Q12072 snR87snR87 109 nt0.41□□□□□ -2.34
IOC2Q12072 YOR309CYOR309C 381 nt0.16□□□□□ -2.38
IOC2Q12072 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt0.11□□□□□ -2.39
IOC2Q12072 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.16□□□□□ -2.44
IOC2Q12072 YNR077CYNR077C 255 nt-0.33□□□□□ -2.46
IOC2Q12072 snR33snR33 183 nt-0.35□□□□□ -2.47
IOC2Q12072 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.57□□□□□ -2.5
IOC2Q12072 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.57□□□□□ -2.5
IOC2Q12072 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.57□□□□□ -2.5
IOC2Q12072 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-0.69□□□□□ -2.52
IOC2Q12072 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.76□□□□□ -2.53
IOC2Q12072 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-1.35□□□□□ -2.63
IOC2Q12072 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-1.39□□□□□ -2.63
IOC2Q12072 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.56□□□□□ -2.66
IOC2Q12072 YDR543CYDR543C 300 nt-1.7□□□□□ -2.68
IOC2Q12072 YJR162CYJR162C 351 nt-2.6□□□□□ -2.83
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