Protein–RNA interactions for Protein: P36062

AVT3, Vacuolar amino acid transporter 3, yeastyeast

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT3P36062 YMR114CYMR114C 1107 nt15.07■□□□□ 0
AVT3P36062 PRM4YPL156C 855 nt15.07■□□□□ 0
AVT3P36062 SUT2YPR009W 807 nt15.07■□□□□ 0
AVT3P36062 MAF1YDR005C 1188 nt15.06■□□□□ 0
AVT3P36062 MIX17YMR002W 471 nt15.06■□□□□ 0
AVT3P36062 YNL165WYNL165W 1221 nt15.06■□□□□ 0
AVT3P36062 LYS12YIL094C 1116 nt15.05■□□□□ -0
AVT3P36062 NAS6YGR232W 687 nt15.04■□□□□ -0
AVT3P36062 MSA2YKR077W 1092 nt15.04■□□□□ -0
AVT3P36062 YOL107WYOL107W 1029 nt15.04■□□□□ -0
AVT3P36062 ECM9YKR004C 1134 nt15.03■□□□□ -0
AVT3P36062 CSI1YMR025W 888 nt15.03■□□□□ -0
AVT3P36062 YPR150WYPR150W 522 nt15.03■□□□□ -0
AVT3P36062 YNL319WYNL319W 441 nt15.02■□□□□ -0
AVT3P36062 YNL303WYNL303W 348 nt15.01□□□□□ -0.01
AVT3P36062 CWC25YNL245C 540 nt14.99□□□□□ -0.01
AVT3P36062 YOR139CYOR139C 393 nt14.99□□□□□ -0.01
AVT3P36062 SPT5YML010W 3192 nt14.98□□□□□ -0.01
AVT3P36062 DLD2YDL178W 1593 nt14.97□□□□□ -0.01
AVT3P36062 ALG7YBR243C 1347 nt14.96□□□□□ -0.01
AVT3P36062 OCA1YNL099C 717 nt14.96□□□□□ -0.01
AVT3P36062 snR189snR189 189 nt14.96□□□□□ -0.01
AVT3P36062 PZF1YPR186C 1290 nt14.96□□□□□ -0.01
AVT3P36062 OSW1YOR255W 837 nt14.95□□□□□ -0.02
AVT3P36062 DSE3YOR264W 1293 nt14.95□□□□□ -0.02
AVT3P36062 PRE2YPR103W 864 nt14.95□□□□□ -0.02
AVT3P36062 SVF1YDR346C 1446 nt14.94□□□□□ -0.02
AVT3P36062 ZTA1YBR046C 1005 nt14.94□□□□□ -0.02
AVT3P36062 BDF1YLR399C 2061 nt14.93□□□□□ -0.02
AVT3P36062 RMA1YKL132C 1293 nt14.93□□□□□ -0.02
AVT3P36062 RSC4YKR008W 1878 nt14.93□□□□□ -0.02
AVT3P36062 RNQ1YCL028W 1218 nt14.91□□□□□ -0.02
AVT3P36062 snR34snR34 203 nt14.88□□□□□ -0.03
AVT3P36062 IDI1YPL117C 867 nt14.87□□□□□ -0.03
AVT3P36062 RAI1YGL246C 1164 nt14.85□□□□□ -0.03
AVT3P36062 RER1YCL001W 567 nt14.85□□□□□ -0.03
AVT3P36062 PUS9YDL036C 1389 nt14.85□□□□□ -0.03
AVT3P36062 YGR283CYGR283C 1026 nt14.84□□□□□ -0.03
AVT3P36062 TIR1YER011W 765 nt14.82□□□□□ -0.04
AVT3P36062 YLR460CYLR460C 1131 nt14.81□□□□□ -0.04
AVT3P36062 DEP1YAL013W 1218 nt14.8□□□□□ -0.04
AVT3P36062 NPL3YDR432W 1245 nt14.79□□□□□ -0.04
AVT3P36062 PEX22YAL055W 543 nt14.79□□□□□ -0.04
AVT3P36062 YNL208WYNL208W 600 nt14.79□□□□□ -0.04
AVT3P36062 NUF2YOL069W 1356 nt14.79□□□□□ -0.04
AVT3P36062 YLR169WYLR169W 354 nt14.78□□□□□ -0.04
AVT3P36062 HAT2YEL056W 1206 nt14.76□□□□□ -0.05
AVT3P36062 RPN10YHR200W 807 nt14.76□□□□□ -0.05
AVT3P36062 NMD4YLR363C 657 nt14.76□□□□□ -0.05
AVT3P36062 HAS1YMR290C 1518 nt14.76□□□□□ -0.05
AVT3P36062 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.74□□□□□ -0.05
AVT3P36062 ERG29YMR134W 714 nt14.73□□□□□ -0.05
AVT3P36062 URN1YPR152C 1398 nt14.72□□□□□ -0.05
AVT3P36062 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt14.71□□□□□ -0.05
AVT3P36062 IRC14YOR135C 342 nt14.71□□□□□ -0.05
AVT3P36062 NUR1YDL089W 1455 nt14.7□□□□□ -0.06
AVT3P36062 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt14.7□□□□□ -0.06
AVT3P36062 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt14.7□□□□□ -0.06
AVT3P36062 RSF1YMR030W 1131 nt14.7□□□□□ -0.06
AVT3P36062 MCT1YOR221C 1083 nt14.7□□□□□ -0.06
AVT3P36062 YMR210WYMR210W 1350 nt14.7□□□□□ -0.06
AVT3P36062 NUP57YGR119C 1626 nt14.7□□□□□ -0.06
AVT3P36062 RTG3YBL103C 1461 nt14.69□□□□□ -0.06
AVT3P36062 VAM3YOR106W 852 nt14.68□□□□□ -0.06
AVT3P36062 ERG12YMR208W 1332 nt14.67□□□□□ -0.06
AVT3P36062 BUD16YEL029C 939 nt14.67□□□□□ -0.06
AVT3P36062 SKI6YGR195W 741 nt14.67□□□□□ -0.06
AVT3P36062 RPM1RPM1 483 nt14.67□□□□□ -0.06
AVT3P36062 XDJ1YLR090W 1380 nt14.67□□□□□ -0.06
AVT3P36062 ARC35YNR035C 1029 nt14.66□□□□□ -0.06
AVT3P36062 HAT1YPL001W 1125 nt14.64□□□□□ -0.07
AVT3P36062 TAT1YBR069C 1860 nt14.63□□□□□ -0.07
AVT3P36062 MHO1YJR008W 1017 nt14.63□□□□□ -0.07
AVT3P36062 OAZ1YPL052W 879 nt14.62□□□□□ -0.07
AVT3P36062 YIL092WYIL092W 1902 nt14.62□□□□□ -0.07
AVT3P36062 UME6YDR207C 2511 nt14.61□□□□□ -0.07
AVT3P36062 JJJ3YJR097W 519 nt14.6□□□□□ -0.07
AVT3P36062 REX3YLR107W 1215 nt14.6□□□□□ -0.07
AVT3P36062 DSC2YOL073C 969 nt14.6□□□□□ -0.07
AVT3P36062 RRP17YDR412W 708 nt14.59□□□□□ -0.07
AVT3P36062 PCL6YER059W 1263 nt14.59□□□□□ -0.07
AVT3P36062 YLR198CYLR198C 360 nt14.59□□□□□ -0.07
AVT3P36062 CUS2YNL286W 858 nt14.59□□□□□ -0.07
AVT3P36062 ISA2YPR067W 558 nt14.59□□□□□ -0.07
AVT3P36062 YCR049CYCR049C 447 nt14.58□□□□□ -0.08
AVT3P36062 YHR022CYHR022C 771 nt14.58□□□□□ -0.08
AVT3P36062 RCE1YMR274C 948 nt14.58□□□□□ -0.08
AVT3P36062 YGR168CYGR168C 1131 nt14.57□□□□□ -0.08
AVT3P36062 PTC7YHR076W 1032 nt14.57□□□□□ -0.08
AVT3P36062 DBR1YKL149C 1218 nt14.57□□□□□ -0.08
AVT3P36062 YBR292CYBR292C 372 nt14.56□□□□□ -0.08
AVT3P36062 FES1YBR101C 873 nt14.55□□□□□ -0.08
AVT3P36062 YKR104WYKR104W 921 nt14.54□□□□□ -0.08
AVT3P36062 SPC24YMR117C 642 nt14.54□□□□□ -0.08
AVT3P36062 RRP40YOL142W 723 nt14.53□□□□□ -0.08
AVT3P36062 RRS1YOR294W 612 nt14.52□□□□□ -0.09
AVT3P36062 FSH1YHR049W 732 nt14.48□□□□□ -0.09
AVT3P36062 MER1YNL210W 813 nt14.48□□□□□ -0.09
AVT3P36062 TRP4YDR354W 1143 nt14.47□□□□□ -0.09
AVT3P36062 YGR021WYGR021W 873 nt14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.7 ms