Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
COG6Q9Y2V7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
COG6Q9Y2V7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
COG6Q9Y2V7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
COG6Q9Y2V7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
COG6Q9Y2V7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
COG6Q9Y2V7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
COG6Q9Y2V7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
COG6Q9Y2V7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
COG6Q9Y2V7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
COG6Q9Y2V7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
COG6Q9Y2V7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
COG6Q9Y2V7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
COG6Q9Y2V7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
COG6Q9Y2V7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
COG6Q9Y2V7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
COG6Q9Y2V7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
COG6Q9Y2V7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
COG6Q9Y2V7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
COG6Q9Y2V7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
COG6Q9Y2V7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
COG6Q9Y2V7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
COG6Q9Y2V7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
COG6Q9Y2V7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
COG6Q9Y2V7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
COG6Q9Y2V7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
COG6Q9Y2V7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
COG6Q9Y2V7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
COG6Q9Y2V7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
COG6Q9Y2V7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
COG6Q9Y2V7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
COG6Q9Y2V7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
COG6Q9Y2V7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
COG6Q9Y2V7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
COG6Q9Y2V7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
COG6Q9Y2V7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
COG6Q9Y2V7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
COG6Q9Y2V7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
COG6Q9Y2V7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
COG6Q9Y2V7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
COG6Q9Y2V7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
COG6Q9Y2V7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
COG6Q9Y2V7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
COG6Q9Y2V7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
COG6Q9Y2V7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
COG6Q9Y2V7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
COG6Q9Y2V7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
COG6Q9Y2V7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
COG6Q9Y2V7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
COG6Q9Y2V7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
COG6Q9Y2V7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
COG6Q9Y2V7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
COG6Q9Y2V7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
COG6Q9Y2V7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
COG6Q9Y2V7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
COG6Q9Y2V7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
COG6Q9Y2V7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
COG6Q9Y2V7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
COG6Q9Y2V7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
COG6Q9Y2V7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
COG6Q9Y2V7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
COG6Q9Y2V7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
COG6Q9Y2V7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COG6Q9Y2V7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
COG6Q9Y2V7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COG6Q9Y2V7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COG6Q9Y2V7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
COG6Q9Y2V7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
COG6Q9Y2V7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
COG6Q9Y2V7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COG6Q9Y2V7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
COG6Q9Y2V7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COG6Q9Y2V7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
COG6Q9Y2V7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
COG6Q9Y2V7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
COG6Q9Y2V7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
COG6Q9Y2V7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
COG6Q9Y2V7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
COG6Q9Y2V7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
COG6Q9Y2V7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
COG6Q9Y2V7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
COG6Q9Y2V7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
COG6Q9Y2V7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
COG6Q9Y2V7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
COG6Q9Y2V7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
COG6Q9Y2V7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
COG6Q9Y2V7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
COG6Q9Y2V7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
COG6Q9Y2V7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
COG6Q9Y2V7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
COG6Q9Y2V7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
COG6Q9Y2V7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
COG6Q9Y2V7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
COG6Q9Y2V7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
COG6Q9Y2V7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
COG6Q9Y2V7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
COG6Q9Y2V7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
COG6Q9Y2V7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
COG6Q9Y2V7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
COG6Q9Y2V7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms