Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y251

HPSE, Heparanase, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPSEQ9Y251 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HPSEQ9Y251 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HPSEQ9Y251 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HPSEQ9Y251 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HPSEQ9Y251 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HPSEQ9Y251 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HPSEQ9Y251 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HPSEQ9Y251 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HPSEQ9Y251 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HPSEQ9Y251 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HPSEQ9Y251 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HPSEQ9Y251 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HPSEQ9Y251 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HPSEQ9Y251 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HPSEQ9Y251 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HPSEQ9Y251 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HPSEQ9Y251 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HPSEQ9Y251 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPSEQ9Y251 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPSEQ9Y251 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPSEQ9Y251 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPSEQ9Y251 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPSEQ9Y251 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPSEQ9Y251 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPSEQ9Y251 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPSEQ9Y251 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HPSEQ9Y251 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HPSEQ9Y251 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HPSEQ9Y251 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HPSEQ9Y251 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HPSEQ9Y251 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HPSEQ9Y251 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HPSEQ9Y251 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HPSEQ9Y251 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HPSEQ9Y251 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HPSEQ9Y251 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HPSEQ9Y251 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HPSEQ9Y251 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HPSEQ9Y251 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HPSEQ9Y251 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HPSEQ9Y251 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HPSEQ9Y251 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HPSEQ9Y251 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HPSEQ9Y251 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HPSEQ9Y251 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HPSEQ9Y251 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HPSEQ9Y251 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HPSEQ9Y251 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HPSEQ9Y251 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HPSEQ9Y251 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HPSEQ9Y251 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HPSEQ9Y251 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HPSEQ9Y251 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HPSEQ9Y251 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HPSEQ9Y251 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HPSEQ9Y251 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HPSEQ9Y251 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HPSEQ9Y251 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HPSEQ9Y251 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HPSEQ9Y251 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HPSEQ9Y251 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
HPSEQ9Y251 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HPSEQ9Y251 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HPSEQ9Y251 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HPSEQ9Y251 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HPSEQ9Y251 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HPSEQ9Y251 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HPSEQ9Y251 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HPSEQ9Y251 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HPSEQ9Y251 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HPSEQ9Y251 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HPSEQ9Y251 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HPSEQ9Y251 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HPSEQ9Y251 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HPSEQ9Y251 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HPSEQ9Y251 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HPSEQ9Y251 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HPSEQ9Y251 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HPSEQ9Y251 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HPSEQ9Y251 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HPSEQ9Y251 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HPSEQ9Y251 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HPSEQ9Y251 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HPSEQ9Y251 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HPSEQ9Y251 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HPSEQ9Y251 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HPSEQ9Y251 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HPSEQ9Y251 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HPSEQ9Y251 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HPSEQ9Y251 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HPSEQ9Y251 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HPSEQ9Y251 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HPSEQ9Y251 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HPSEQ9Y251 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HPSEQ9Y251 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HPSEQ9Y251 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HPSEQ9Y251 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HPSEQ9Y251 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HPSEQ9Y251 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HPSEQ9Y251 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms