Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDAP2Q9NXN4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GDAP2Q9NXN4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GDAP2Q9NXN4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms