Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH6

TMLHE, Trimethyllysine dioxygenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMLHEQ9NVH6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMLHEQ9NVH6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMLHEQ9NVH6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms