Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GOPCQ9HD26 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GOPCQ9HD26 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GOPCQ9HD26 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GOPCQ9HD26 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GOPCQ9HD26 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GOPCQ9HD26 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GOPCQ9HD26 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GOPCQ9HD26 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GOPCQ9HD26 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GOPCQ9HD26 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GOPCQ9HD26 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GOPCQ9HD26 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GOPCQ9HD26 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GOPCQ9HD26 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GOPCQ9HD26 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GOPCQ9HD26 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GOPCQ9HD26 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GOPCQ9HD26 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GOPCQ9HD26 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GOPCQ9HD26 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GOPCQ9HD26 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GOPCQ9HD26 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GOPCQ9HD26 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GOPCQ9HD26 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
GOPCQ9HD26 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GOPCQ9HD26 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GOPCQ9HD26 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GOPCQ9HD26 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GOPCQ9HD26 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GOPCQ9HD26 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
GOPCQ9HD26 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GOPCQ9HD26 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GOPCQ9HD26 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GOPCQ9HD26 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GOPCQ9HD26 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GOPCQ9HD26 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GOPCQ9HD26 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GOPCQ9HD26 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GOPCQ9HD26 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GOPCQ9HD26 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GOPCQ9HD26 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GOPCQ9HD26 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GOPCQ9HD26 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GOPCQ9HD26 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GOPCQ9HD26 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GOPCQ9HD26 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GOPCQ9HD26 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GOPCQ9HD26 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GOPCQ9HD26 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GOPCQ9HD26 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GOPCQ9HD26 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GOPCQ9HD26 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GOPCQ9HD26 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GOPCQ9HD26 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GOPCQ9HD26 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GOPCQ9HD26 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GOPCQ9HD26 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GOPCQ9HD26 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GOPCQ9HD26 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GOPCQ9HD26 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GOPCQ9HD26 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GOPCQ9HD26 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GOPCQ9HD26 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GOPCQ9HD26 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GOPCQ9HD26 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GOPCQ9HD26 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GOPCQ9HD26 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GOPCQ9HD26 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GOPCQ9HD26 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GOPCQ9HD26 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GOPCQ9HD26 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GOPCQ9HD26 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GOPCQ9HD26 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GOPCQ9HD26 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GOPCQ9HD26 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GOPCQ9HD26 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GOPCQ9HD26 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GOPCQ9HD26 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GOPCQ9HD26 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GOPCQ9HD26 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GOPCQ9HD26 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOPCQ9HD26 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOPCQ9HD26 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOPCQ9HD26 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOPCQ9HD26 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOPCQ9HD26 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOPCQ9HD26 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GOPCQ9HD26 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GOPCQ9HD26 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GOPCQ9HD26 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GOPCQ9HD26 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GOPCQ9HD26 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOPCQ9HD26 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOPCQ9HD26 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GOPCQ9HD26 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOPCQ9HD26 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOPCQ9HD26 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOPCQ9HD26 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOPCQ9HD26 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.4 ms