Protein–RNA interactions for Protein: Q9H816

DCLRE1B, 5' exonuclease Apollo, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1BQ9H816 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
DCLRE1BQ9H816 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCLRE1BQ9H816 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms