Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLSTN2Q9H4D0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLSTN2Q9H4D0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLSTN2Q9H4D0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLSTN2Q9H4D0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLSTN2Q9H4D0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CLSTN2Q9H4D0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms