Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GFRA4Q9GZZ7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA4Q9GZZ7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms