Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ4

KRTAP9-2, Keratin-associated protein 9-2, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-2Q9BYQ4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP9-2Q9BYQ4 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP9-2Q9BYQ4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP9-2Q9BYQ4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP9-2Q9BYQ4 GOSR1-204ENST00000451249 1231 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP9-2Q9BYQ4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP9-2Q9BYQ4 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP9-2Q9BYQ4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP9-2Q9BYQ4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP9-2Q9BYQ4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP9-2Q9BYQ4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP9-2Q9BYQ4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP9-2Q9BYQ4 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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KRTAP9-2Q9BYQ4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP9-2Q9BYQ4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP9-2Q9BYQ4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP9-2Q9BYQ4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP9-2Q9BYQ4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP9-2Q9BYQ4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP9-2Q9BYQ4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP9-2Q9BYQ4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP9-2Q9BYQ4 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP9-2Q9BYQ4 LINC02270-202ENST00000515691 541 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP9-2Q9BYQ4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP9-2Q9BYQ4 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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KRTAP9-2Q9BYQ4 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP9-2Q9BYQ4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP9-2Q9BYQ4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP9-2Q9BYQ4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP9-2Q9BYQ4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP9-2Q9BYQ4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
KRTAP9-2Q9BYQ4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
KRTAP9-2Q9BYQ4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
KRTAP9-2Q9BYQ4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
KRTAP9-2Q9BYQ4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
KRTAP9-2Q9BYQ4 SMIM26-201ENST00000411646 505 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
KRTAP9-2Q9BYQ4 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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KRTAP9-2Q9BYQ4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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KRTAP9-2Q9BYQ4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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KRTAP9-2Q9BYQ4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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KRTAP9-2Q9BYQ4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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KRTAP9-2Q9BYQ4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP9-2Q9BYQ4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP9-2Q9BYQ4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP9-2Q9BYQ4 SMIM11A-201ENST00000399292 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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KRTAP9-2Q9BYQ4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP9-2Q9BYQ4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP9-2Q9BYQ4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP9-2Q9BYQ4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP9-2Q9BYQ4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP9-2Q9BYQ4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP9-2Q9BYQ4 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP9-2Q9BYQ4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP9-2Q9BYQ4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP9-2Q9BYQ4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP9-2Q9BYQ4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP9-2Q9BYQ4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP9-2Q9BYQ4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP9-2Q9BYQ4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP9-2Q9BYQ4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP9-2Q9BYQ4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP9-2Q9BYQ4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP9-2Q9BYQ4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP9-2Q9BYQ4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP9-2Q9BYQ4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP9-2Q9BYQ4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP9-2Q9BYQ4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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