Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GSDMCQ9BYG8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms