Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG2

SH2D3A, SH2 domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D3AQ9BRG2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SH2D3AQ9BRG2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH2D3AQ9BRG2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH2D3AQ9BRG2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH2D3AQ9BRG2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH2D3AQ9BRG2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH2D3AQ9BRG2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SH2D3AQ9BRG2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH2D3AQ9BRG2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH2D3AQ9BRG2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH2D3AQ9BRG2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH2D3AQ9BRG2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SH2D3AQ9BRG2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SH2D3AQ9BRG2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SH2D3AQ9BRG2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SH2D3AQ9BRG2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SH2D3AQ9BRG2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SH2D3AQ9BRG2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SH2D3AQ9BRG2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SH2D3AQ9BRG2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH2D3AQ9BRG2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH2D3AQ9BRG2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH2D3AQ9BRG2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH2D3AQ9BRG2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SH2D3AQ9BRG2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH2D3AQ9BRG2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SH2D3AQ9BRG2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH2D3AQ9BRG2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SH2D3AQ9BRG2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SH2D3AQ9BRG2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SH2D3AQ9BRG2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SH2D3AQ9BRG2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH2D3AQ9BRG2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH2D3AQ9BRG2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH2D3AQ9BRG2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH2D3AQ9BRG2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH2D3AQ9BRG2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH2D3AQ9BRG2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SH2D3AQ9BRG2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SH2D3AQ9BRG2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH2D3AQ9BRG2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms