Protein–RNA interactions for Protein: Q99608

NDN, Necdin, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDNQ99608 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDNQ99608 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDNQ99608 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NDNQ99608 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDNQ99608 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDNQ99608 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDNQ99608 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDNQ99608 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDNQ99608 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDNQ99608 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDNQ99608 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDNQ99608 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDNQ99608 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDNQ99608 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDNQ99608 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NDNQ99608 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDNQ99608 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDNQ99608 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDNQ99608 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NDNQ99608 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NDNQ99608 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDNQ99608 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDNQ99608 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDNQ99608 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDNQ99608 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NDNQ99608 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDNQ99608 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDNQ99608 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDNQ99608 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDNQ99608 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDNQ99608 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDNQ99608 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDNQ99608 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDNQ99608 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDNQ99608 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDNQ99608 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDNQ99608 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDNQ99608 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDNQ99608 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDNQ99608 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDNQ99608 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDNQ99608 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDNQ99608 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDNQ99608 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDNQ99608 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDNQ99608 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDNQ99608 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDNQ99608 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDNQ99608 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDNQ99608 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDNQ99608 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDNQ99608 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDNQ99608 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDNQ99608 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDNQ99608 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDNQ99608 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDNQ99608 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDNQ99608 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDNQ99608 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDNQ99608 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDNQ99608 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDNQ99608 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDNQ99608 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDNQ99608 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDNQ99608 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDNQ99608 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDNQ99608 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDNQ99608 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDNQ99608 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDNQ99608 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDNQ99608 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDNQ99608 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDNQ99608 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDNQ99608 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDNQ99608 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDNQ99608 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDNQ99608 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDNQ99608 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDNQ99608 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDNQ99608 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDNQ99608 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDNQ99608 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDNQ99608 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDNQ99608 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDNQ99608 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDNQ99608 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDNQ99608 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NDNQ99608 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NDNQ99608 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDNQ99608 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDNQ99608 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NDNQ99608 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NDNQ99608 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NDNQ99608 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDNQ99608 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDNQ99608 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDNQ99608 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDNQ99608 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDNQ99608 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDNQ99608 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms