Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRRC1Q96M27 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRRC1Q96M27 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRRC1Q96M27 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms