Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF479Q96JC4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms