Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF6Q96J87 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CELF6Q96J87 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms