Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCOLN3Q8TDD5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms