Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU7

C2CD4A, C2 calcium-dependent domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2CD4AQ8NCU7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
C2CD4AQ8NCU7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C2CD4AQ8NCU7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.1 ms