Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PPARGC1BQ86YN6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PPARGC1BQ86YN6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PPARGC1BQ86YN6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PPARGC1BQ86YN6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PPARGC1BQ86YN6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PPARGC1BQ86YN6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
PPARGC1BQ86YN6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
PPARGC1BQ86YN6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PPARGC1BQ86YN6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PPARGC1BQ86YN6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
PPARGC1BQ86YN6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PPARGC1BQ86YN6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PPARGC1BQ86YN6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PPARGC1BQ86YN6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PPARGC1BQ86YN6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PPARGC1BQ86YN6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PPARGC1BQ86YN6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PPARGC1BQ86YN6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PPARGC1BQ86YN6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PPARGC1BQ86YN6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PPARGC1BQ86YN6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PPARGC1BQ86YN6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PPARGC1BQ86YN6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PPARGC1BQ86YN6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PPARGC1BQ86YN6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PPARGC1BQ86YN6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PPARGC1BQ86YN6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PPARGC1BQ86YN6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PPARGC1BQ86YN6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PPARGC1BQ86YN6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PPARGC1BQ86YN6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PPARGC1BQ86YN6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PPARGC1BQ86YN6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PPARGC1BQ86YN6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
PPARGC1BQ86YN6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PPARGC1BQ86YN6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PPARGC1BQ86YN6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PPARGC1BQ86YN6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PPARGC1BQ86YN6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PPARGC1BQ86YN6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
PPARGC1BQ86YN6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
PPARGC1BQ86YN6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PPARGC1BQ86YN6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PPARGC1BQ86YN6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PPARGC1BQ86YN6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PPARGC1BQ86YN6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PPARGC1BQ86YN6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PPARGC1BQ86YN6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
PPARGC1BQ86YN6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PPARGC1BQ86YN6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PPARGC1BQ86YN6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PPARGC1BQ86YN6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PPARGC1BQ86YN6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PPARGC1BQ86YN6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PPARGC1BQ86YN6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PPARGC1BQ86YN6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PPARGC1BQ86YN6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PPARGC1BQ86YN6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PPARGC1BQ86YN6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PPARGC1BQ86YN6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PPARGC1BQ86YN6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PPARGC1BQ86YN6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PPARGC1BQ86YN6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PPARGC1BQ86YN6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PPARGC1BQ86YN6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PPARGC1BQ86YN6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PPARGC1BQ86YN6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PPARGC1BQ86YN6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PPARGC1BQ86YN6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PPARGC1BQ86YN6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PPARGC1BQ86YN6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PPARGC1BQ86YN6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PPARGC1BQ86YN6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PPARGC1BQ86YN6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PPARGC1BQ86YN6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PPARGC1BQ86YN6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PPARGC1BQ86YN6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PPARGC1BQ86YN6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PPARGC1BQ86YN6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PPARGC1BQ86YN6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PPARGC1BQ86YN6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PPARGC1BQ86YN6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
PPARGC1BQ86YN6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
PPARGC1BQ86YN6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PPARGC1BQ86YN6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PPARGC1BQ86YN6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PPARGC1BQ86YN6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PPARGC1BQ86YN6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PPARGC1BQ86YN6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PPARGC1BQ86YN6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PPARGC1BQ86YN6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PPARGC1BQ86YN6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PPARGC1BQ86YN6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PPARGC1BQ86YN6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PPARGC1BQ86YN6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PPARGC1BQ86YN6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
PPARGC1BQ86YN6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PPARGC1BQ86YN6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
PPARGC1BQ86YN6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms