Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTU1Q7Z7A3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTU1Q7Z7A3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTU1Q7Z7A3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTU1Q7Z7A3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTU1Q7Z7A3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTU1Q7Z7A3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTU1Q7Z7A3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTU1Q7Z7A3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTU1Q7Z7A3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTU1Q7Z7A3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTU1Q7Z7A3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTU1Q7Z7A3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTU1Q7Z7A3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms