Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
WDR53Q7Z5U6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
WDR53Q7Z5U6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110 ms