Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC62Q6P9F0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC62Q6P9F0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC62Q6P9F0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC62Q6P9F0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC62Q6P9F0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC62Q6P9F0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC62Q6P9F0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC62Q6P9F0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC62Q6P9F0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC62Q6P9F0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC62Q6P9F0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC62Q6P9F0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC62Q6P9F0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC62Q6P9F0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC62Q6P9F0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC62Q6P9F0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC62Q6P9F0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC62Q6P9F0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC62Q6P9F0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC62Q6P9F0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC62Q6P9F0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC62Q6P9F0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC62Q6P9F0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC62Q6P9F0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC62Q6P9F0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC62Q6P9F0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC62Q6P9F0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC62Q6P9F0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC62Q6P9F0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC62Q6P9F0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC62Q6P9F0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC62Q6P9F0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC62Q6P9F0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC62Q6P9F0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC62Q6P9F0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC62Q6P9F0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC62Q6P9F0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC62Q6P9F0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC62Q6P9F0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC62Q6P9F0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC62Q6P9F0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC62Q6P9F0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC62Q6P9F0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC62Q6P9F0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC62Q6P9F0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms