Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF544Q6NX49 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms