Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBAP2Q5T6F2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBAP2Q5T6F2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBAP2Q5T6F2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBAP2Q5T6F2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBAP2Q5T6F2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBAP2Q5T6F2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
UBAP2Q5T6F2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBAP2Q5T6F2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
UBAP2Q5T6F2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBAP2Q5T6F2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBAP2Q5T6F2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBAP2Q5T6F2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBAP2Q5T6F2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBAP2Q5T6F2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBAP2Q5T6F2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBAP2Q5T6F2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
UBAP2Q5T6F2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBAP2Q5T6F2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBAP2Q5T6F2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBAP2Q5T6F2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBAP2Q5T6F2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBAP2Q5T6F2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBAP2Q5T6F2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBAP2Q5T6F2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBAP2Q5T6F2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBAP2Q5T6F2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBAP2Q5T6F2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
UBAP2Q5T6F2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBAP2Q5T6F2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBAP2Q5T6F2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBAP2Q5T6F2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
UBAP2Q5T6F2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBAP2Q5T6F2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBAP2Q5T6F2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBAP2Q5T6F2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBAP2Q5T6F2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBAP2Q5T6F2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms