Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL39P5Q59GN2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPL39P5Q59GN2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 196 ms