Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP25-1Q3LHN0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP25-1Q3LHN0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP25-1Q3LHN0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP25-1Q3LHN0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP25-1Q3LHN0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP25-1Q3LHN0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP25-1Q3LHN0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP25-1Q3LHN0 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP25-1Q3LHN0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP25-1Q3LHN0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP25-1Q3LHN0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP25-1Q3LHN0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP25-1Q3LHN0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP25-1Q3LHN0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP25-1Q3LHN0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP25-1Q3LHN0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP25-1Q3LHN0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP25-1Q3LHN0 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP25-1Q3LHN0 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP25-1Q3LHN0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP25-1Q3LHN0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP25-1Q3LHN0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP25-1Q3LHN0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP25-1Q3LHN0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP25-1Q3LHN0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP25-1Q3LHN0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP25-1Q3LHN0 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP25-1Q3LHN0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP25-1Q3LHN0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP25-1Q3LHN0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP25-1Q3LHN0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP25-1Q3LHN0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP25-1Q3LHN0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP25-1Q3LHN0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP25-1Q3LHN0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP25-1Q3LHN0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP25-1Q3LHN0 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP25-1Q3LHN0 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP25-1Q3LHN0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP25-1Q3LHN0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP25-1Q3LHN0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP25-1Q3LHN0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP25-1Q3LHN0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP25-1Q3LHN0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP25-1Q3LHN0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP25-1Q3LHN0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP25-1Q3LHN0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP25-1Q3LHN0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP25-1Q3LHN0 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP25-1Q3LHN0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
KRTAP25-1Q3LHN0 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
KRTAP25-1Q3LHN0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
KRTAP25-1Q3LHN0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
KRTAP25-1Q3LHN0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
KRTAP25-1Q3LHN0 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
KRTAP25-1Q3LHN0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP25-1Q3LHN0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP25-1Q3LHN0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP25-1Q3LHN0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP25-1Q3LHN0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP25-1Q3LHN0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP25-1Q3LHN0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP25-1Q3LHN0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP25-1Q3LHN0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP25-1Q3LHN0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP25-1Q3LHN0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP25-1Q3LHN0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP25-1Q3LHN0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP25-1Q3LHN0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP25-1Q3LHN0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP25-1Q3LHN0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP25-1Q3LHN0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP25-1Q3LHN0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP25-1Q3LHN0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP25-1Q3LHN0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP25-1Q3LHN0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP25-1Q3LHN0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP25-1Q3LHN0 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP25-1Q3LHN0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP25-1Q3LHN0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP25-1Q3LHN0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP25-1Q3LHN0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP25-1Q3LHN0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP25-1Q3LHN0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP25-1Q3LHN0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP25-1Q3LHN0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP25-1Q3LHN0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP25-1Q3LHN0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP25-1Q3LHN0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP25-1Q3LHN0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP25-1Q3LHN0 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP25-1Q3LHN0 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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