Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PROX2Q3B8N5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PROX2Q3B8N5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms