Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2I5

KRT24, Keratin, type I cytoskeletal 24, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT24Q2M2I5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KRT24Q2M2I5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KRT24Q2M2I5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KRT24Q2M2I5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KRT24Q2M2I5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT24Q2M2I5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT24Q2M2I5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT24Q2M2I5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT24Q2M2I5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT24Q2M2I5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT24Q2M2I5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT24Q2M2I5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT24Q2M2I5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KRT24Q2M2I5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
KRT24Q2M2I5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
KRT24Q2M2I5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
KRT24Q2M2I5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KRT24Q2M2I5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KRT24Q2M2I5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KRT24Q2M2I5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KRT24Q2M2I5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KRT24Q2M2I5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
KRT24Q2M2I5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
KRT24Q2M2I5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KRT24Q2M2I5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KRT24Q2M2I5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KRT24Q2M2I5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KRT24Q2M2I5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KRT24Q2M2I5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KRT24Q2M2I5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KRT24Q2M2I5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KRT24Q2M2I5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KRT24Q2M2I5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KRT24Q2M2I5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KRT24Q2M2I5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KRT24Q2M2I5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
KRT24Q2M2I5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KRT24Q2M2I5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.3 ms