Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CTF1Q16619 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTF1Q16619 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CTF1Q16619 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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