Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAD1Q15797 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAD1Q15797 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAD1Q15797 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAD1Q15797 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAD1Q15797 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAD1Q15797 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAD1Q15797 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAD1Q15797 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAD1Q15797 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAD1Q15797 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAD1Q15797 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD1Q15797 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD1Q15797 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD1Q15797 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD1Q15797 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD1Q15797 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD1Q15797 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD1Q15797 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD1Q15797 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD1Q15797 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD1Q15797 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD1Q15797 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD1Q15797 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD1Q15797 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD1Q15797 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAD1Q15797 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAD1Q15797 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAD1Q15797 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAD1Q15797 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAD1Q15797 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAD1Q15797 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAD1Q15797 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMAD1Q15797 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMAD1Q15797 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMAD1Q15797 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMAD1Q15797 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMAD1Q15797 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
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