Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TAF1CQ15572 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TAF1CQ15572 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TAF1CQ15572 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TAF1CQ15572 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TAF1CQ15572 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TAF1CQ15572 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TAF1CQ15572 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TAF1CQ15572 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TAF1CQ15572 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TAF1CQ15572 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TAF1CQ15572 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TAF1CQ15572 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TAF1CQ15572 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TAF1CQ15572 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TAF1CQ15572 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TAF1CQ15572 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TAF1CQ15572 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TAF1CQ15572 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TAF1CQ15572 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TAF1CQ15572 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TAF1CQ15572 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TAF1CQ15572 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TAF1CQ15572 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TAF1CQ15572 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TAF1CQ15572 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAF1CQ15572 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TAF1CQ15572 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAF1CQ15572 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAF1CQ15572 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAF1CQ15572 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAF1CQ15572 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAF1CQ15572 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAF1CQ15572 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAF1CQ15572 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAF1CQ15572 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAF1CQ15572 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TAF1CQ15572 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAF1CQ15572 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAF1CQ15572 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TAF1CQ15572 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TAF1CQ15572 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAF1CQ15572 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TAF1CQ15572 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms