Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SPTAN1Q13813 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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