Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC63Q05C16 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC63Q05C16 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC63Q05C16 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC63Q05C16 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC63Q05C16 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC63Q05C16 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC63Q05C16 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC63Q05C16 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC63Q05C16 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC63Q05C16 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC63Q05C16 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC63Q05C16 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC63Q05C16 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC63Q05C16 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC63Q05C16 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC63Q05C16 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC63Q05C16 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC63Q05C16 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC63Q05C16 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC63Q05C16 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC63Q05C16 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC63Q05C16 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC63Q05C16 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC63Q05C16 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC63Q05C16 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRRC63Q05C16 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC63Q05C16 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC63Q05C16 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC63Q05C16 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC63Q05C16 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC63Q05C16 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC63Q05C16 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC63Q05C16 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC63Q05C16 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC63Q05C16 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC63Q05C16 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC63Q05C16 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC63Q05C16 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC63Q05C16 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC63Q05C16 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC63Q05C16 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC63Q05C16 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC63Q05C16 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC63Q05C16 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC63Q05C16 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC63Q05C16 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC63Q05C16 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC63Q05C16 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC63Q05C16 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC63Q05C16 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC63Q05C16 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC63Q05C16 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC63Q05C16 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC63Q05C16 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC63Q05C16 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC63Q05C16 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC63Q05C16 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC63Q05C16 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC63Q05C16 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC63Q05C16 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC63Q05C16 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC63Q05C16 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC63Q05C16 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC63Q05C16 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC63Q05C16 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC63Q05C16 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC63Q05C16 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC63Q05C16 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC63Q05C16 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC63Q05C16 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC63Q05C16 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC63Q05C16 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC63Q05C16 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC63Q05C16 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC63Q05C16 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC63Q05C16 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC63Q05C16 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC63Q05C16 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC63Q05C16 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC63Q05C16 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC63Q05C16 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC63Q05C16 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC63Q05C16 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC63Q05C16 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC63Q05C16 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC63Q05C16 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC63Q05C16 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC63Q05C16 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC63Q05C16 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC63Q05C16 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC63Q05C16 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC63Q05C16 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC63Q05C16 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC63Q05C16 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC63Q05C16 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC63Q05C16 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC63Q05C16 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC63Q05C16 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC63Q05C16 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms