Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AIF1P55008 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
AIF1P55008 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AIF1P55008 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AIF1P55008 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AIF1P55008 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AIF1P55008 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AIF1P55008 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AIF1P55008 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AIF1P55008 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AIF1P55008 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AIF1P55008 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AIF1P55008 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AIF1P55008 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AIF1P55008 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AIF1P55008 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AIF1P55008 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AIF1P55008 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AIF1P55008 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AIF1P55008 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AIF1P55008 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AIF1P55008 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AIF1P55008 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AIF1P55008 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AIF1P55008 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AIF1P55008 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AIF1P55008 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AIF1P55008 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AIF1P55008 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AIF1P55008 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AIF1P55008 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AIF1P55008 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AIF1P55008 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AIF1P55008 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AIF1P55008 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AIF1P55008 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AIF1P55008 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AIF1P55008 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AIF1P55008 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AIF1P55008 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AIF1P55008 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AIF1P55008 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AIF1P55008 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AIF1P55008 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AIF1P55008 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AIF1P55008 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
AIF1P55008 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AIF1P55008 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AIF1P55008 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AIF1P55008 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AIF1P55008 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AIF1P55008 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AIF1P55008 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AIF1P55008 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AIF1P55008 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AIF1P55008 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AIF1P55008 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AIF1P55008 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AIF1P55008 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AIF1P55008 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AIF1P55008 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AIF1P55008 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AIF1P55008 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AIF1P55008 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AIF1P55008 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AIF1P55008 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
AIF1P55008 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AIF1P55008 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AIF1P55008 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AIF1P55008 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AIF1P55008 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AIF1P55008 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AIF1P55008 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AIF1P55008 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AIF1P55008 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AIF1P55008 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
AIF1P55008 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AIF1P55008 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AIF1P55008 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AIF1P55008 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AIF1P55008 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AIF1P55008 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AIF1P55008 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AIF1P55008 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AIF1P55008 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AIF1P55008 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AIF1P55008 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AIF1P55008 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AIF1P55008 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AIF1P55008 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AIF1P55008 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AIF1P55008 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AIF1P55008 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AIF1P55008 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AIF1P55008 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AIF1P55008 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AIF1P55008 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AIF1P55008 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
AIF1P55008 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
AIF1P55008 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms