Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKAA2P54646 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKAA2P54646 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms